El comisario de la región malasia de Sabah, Datuk Abdul Rashid Harun, aseveró que facilitó a Indonesia las declaraciones de los tripulantes que escaparon la víspera.
La guardia costera de Kuala Lumpur rescató a un tripulante herido y acogió a otros cinco que sortearon a los captores.
Los piratas actuaron en aguas internacionales, pero cercanas a la frontera marítima de Malasia.
Según los sobrevivientes, hay cuatro indonesios secuestrados, posiblemente a manos del grupo insurgente filipino Abu Sayyaf.
Este es el tercer incidente de piratería en un mes que involucra a marineros indonesios.
La organización armada Abu Sayyaf opera desde la década de 1990 en el sur de Filipinas y se basa en el secuestro y extorsión para lograr sus fines separatistas.
Esa formación rebelde reivindica la autonomía de varias provincias donde se concentra la minoría musulmana.